三十一难 论三焦之部位与作用
三十一难曰：三焦者，何禀？何生？何始？何终？其治常在何许？可晓以不？然：三焦者，水谷之道路，气之所终始也。上焦者，在心下下鬲，在胃上口，主内而不出，其治在膻中，玉堂下一寸六分，直两乳间陷者是。中焦者，在胃中脘，不上不下，主腐熟水谷，其治在脐傍。下焦者，当膀胱上口，主分别清浊，主出而不内，以传道也，其治在脐下一寸。故名曰三焦，其府在气街（一本作“冲”）。
三十二难 论心肺独在鬲上
三十二难曰：五藏俱等，而心肺独在鬲上者，何也？然：心者血，肺者气，血为荣，气为卫，相随上下，谓之荣卫，通行经络，营周于外，故令心肺在鬲上也。
三十三难 论肝肺色象浮沉之理
三十三难曰：肝青象木，肺白象金，肝得水而沉，木得水而浮，肺得水而浮，金得水而沉，其意何也？然：肝者非为纯木也，乙角也，庚之柔，大言阴与阳，小言夫与妇，释其微阳，而吸其微阴之气，其意乐金，又行阴道多，故令肝得水而沉也。肺者非为纯金也，辛商也，丙之柔，大言阴与阳，小言夫与妇，释其微阴，婚而就火，其意乐火，又行阳道多，故令肺得水而浮也。肺熟而复沉，肝熟而复浮者，何也？故知辛当归庚，乙当归甲也。
三十四难 论五脏之声色臭味液与七神
三十四难曰：五藏各有声色臭味，皆可晓知以不？然：十变言：肝色青，其臭臊，其味酸，其声呼，其液泣。心色赤，其臭焦，其味苦，其声言，其液汁。脾色黄，其臭香，其味甘，其声歌，其液涎。肺色白，其臭腥，其味辛，其声哭，其液涕。肾色黑，其臭腐，其味咸，其声呻，其液唾。是五藏声色臭味也。
五藏有七神，各何所藏耶？然：藏者，人之神气所舍藏也。故肝藏魂，肺藏魄，心藏神，脾藏意与智，肾藏精与志也。
三十五难 论诸腑之功能与五脏之相配
三十五难曰：五藏各有所，府皆相近，而心肺独去大肠小肠远者，何也？然：经言：“心荣肺卫，通行阳气，故居在上。大肠小肠传阴气而下，故居在下。”所以相去而远也。
又诸府者，皆阳也，清净之处，今大肠小肠、胃与膀胱，皆受不净，其意何也？
然：诸府者谓是，非也。经言：“小肠者，受盛之府也；大肠者，传写行道之府也；胆者，清净之府也；胃者，水谷之府也；膀胱者，津液之府也。”一府犹无两名，故知非也。小肠者，心之府；大肠者，肺之府；胆者，肝之府；胃者，脾之府；膀胱者，肾之府。
小肠谓赤肠，大肠谓白肠，胆者谓青肠，胃者谓黄肠，膀胱者谓黑肠，下焦之所治也。
三十六难 论肾与命门
三十六难曰：藏各有一耳，肾独有两者，何也？然：肾两者，非皆肾也，其左者为肾，右者为命门。命门者，诸神精之所舍，原气之所系也，男子以藏精，女子以系胞，故知肾有一也。
三十七难 论五脏上关九窍与脏腑不和之病机
三十七难曰：五藏之气，于何发起？通于何许？可晓以不？然：五藏者，当上关于九窍也。故肺气通于鼻，鼻和则知香臭矣；肝气通于目，目和则知黑白矣；脾气通于口，口和则知谷味矣；心气通于舌，舌和则知五味矣；肾气通于耳，耳和则知五音矣。
五藏不和，则九窍不通；六府不和，则留结为痈。
邪在六府，则阳脉不和，阳脉不和，则气留之，气留之，则阳脉盛矣。邪在五藏，则阴脉不和，阴脉不和，则血留之，血留之，则阴脉盛矣。阴气太盛，则阳气不得相营也，故曰格。阳气太盛，则阴气不得相营也，故曰关。阴阳俱盛，不得相营也，故曰关格，关格者，不得尽其命而死矣。
经言：气独行于五藏，不营于六府者，何也？然：夫气之所行也，如水之流，不得息也，故阴脉营于五藏，阳脉营于六府，如环无端，莫知其纪，终而复始，其不覆溢。人气内温于藏府，外濡于腠理。
三十八难 论腑何独有六
三十八难曰：藏唯有五，府独有六者，何也？然：所以府有六者，谓三焦也，有原气之别焉，主持诸气，有名而无形，其经属手少阳，此外府也，故言府有六焉。
三十九难 论腑五脏六
三十九难曰：经言：“府有五，藏有六”者，何也？然：六府者，正有五府也。
五藏亦有六藏者，谓肾有两藏也，其左为肾，右为命门。命门者，精神之所舍也男子以藏精，女子以系胞，其气与肾通，故言藏有六也。府有五者，何也？然：五藏各一府，三焦亦是一府，然不属于五藏，故言府有五焉。
四十难 论鼻臭耳闻之意
四十难曰：经言：“肝主色，心主臭，脾主味，肺主声，肾主液。”鼻者肺之候，而反知香臭；耳者肾之候，而反闻声；其意何也？然：肺者，西方金也，金生于巳，巳者南方火，火者心，心主臭，故令鼻知香臭。肾者，北方水也，水生于申，申者西方金，金者肺，肺主声，故令耳闻声。
